人体是一个有机的整体，其系统之间的有机一体化功能是绝对无法以系统区分开来的。新的整体整合生理学医学理论认为，人作为一个完整的有机整体，呼吸为生命表征，血液循环为基础，代谢为前提，氧化能量物质供应能量为代谢的核心，在神经体液联合调控之下，在消化吸收、泌尿、排泄、皮肤等协助配合之下，从而实现的一种动态地趋向于平衡，而永远达不到真正平衡的一种功能状态。

呼吸调控以血气（O2-CO2-[H+]）为主要调控信号，同一个时段，信号分别通过快感受器经中枢整合调控下次呼吸；同时该信号延迟到达延髓感受器，经中枢对相应延迟后的那次呼吸进行调控。

整体整合生理学/医学新理论，吸收了现代科学相关知识，并将空间和时间两大要素同时加入生命整体调控分析中，恢复了生命调控的整体性和复杂性。
该理论的显著特点为：

第一，以”B-by-B”方式（一呼一吸，周而复始）进行调控的机制，解释了呼吸这一生命表象。

第二，人体生命调控的信号是多种多样多层次的，但在全身发挥主导、最原始的信号为血气和营养能量物质。

第三，各种信号在人体内各个不同部位都永远没有真正稳态，呈连续动态趋向于平衡。

第四，人体三维空间解剖结构的异同，各种信号从产生到通过神经体液的传送以及到达各个效应器之后产生反应的时间都不相同。

第五，人体整体功能一体化自主调控，各个功能系统虽分主次，但却是所有系统相互影响、同时或顺序发生变化的。整体的相对动态平衡绝对排除了某个或一些系统稳定与不变。

第六，信号与效应关系是非线性，且受时、空等多重因素影响并存的复杂关系。

第七，“整体整合”即整体之下分系统功能描述：虽然否定了各个功能系统独立存在和调控的存在，但限于所有医学工作者已受系统论教育，解释生命调控时继续延用传统的呼吸、血液循环、代谢、神经、消化吸收等系统，进行该系统为主描述，因此称为“整体整合生理学医学”。就呼吸而言，称为“整体整合呼吸生理学和整体整合呼吸病学”。